在小麦条锈病、赤霉病等重大病害的发生规律、致病机理与防治技术研究等方面开展了系统的研究
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康振生长期从事小麦重大病害发生规律与防控技术研究工作。揭示了小麦条锈菌致病性变异途径与机理，明确了中国“条锈菌越夏易变区”的形成原因，构建了小麦条锈病综合治理技术体系，使中国小麦条锈病得到有效控制。发现了赤霉菌在小麦穗部的侵染方式与扩展途径，确定了病害防控的关键时期，创建的小麦赤霉病综合防控技术体系在中国主产麦区应用推广，取得了显著的效益。康振生一直以病原真菌与寄主小麦的互作关系为主攻方向，从组织学、细胞学、遗传学及分子生物学等方面对小麦抗病机制和病菌致病机理进行了较为系统的探索，并形成了具有特色的研究体系。主要开展小麦锈病的流行学及分子生态学、小麦条锈菌的基因组学及毒性变异规律、条锈菌与寄主互作分子机理、小麦抗病资源的发掘利用以及寄主抗病机理的研究等。
