段金廒长期致力于中药资源化学研究与资源循环利用、方剂功效物质与类方衍化关系、中药配伍禁忌与临床合理用药等领域的研究及资源产业化工作。围绕中药资源产业化全过程产生的传统非药用部位、药材生产加工过程的下脚料、资源性产品深加工过程的固液废弃物等开展基础性研究和循环利用模式及其再生利用的探索，致力于中药资源化学学科的建立及其科技创新。截至2016年10月，段金廒以中药资源为原料研制开发中药新药5项，新药材原料及功能型产品生产批件3个，研究制（修）订国家、行业和企业产品和生产技术标准36项。