欧阳平凯组建和领导了国家生物化工技术研究中心；创造性地提出运用组合合成的方法构建与优化生物化工过程，在复杂的酶系中将反应与反应组合、反应与生物膜组合、反应与分离组合，使中国FDP、L-丙氨酸、L-苯丙氨酸、L-苹果酸的生产技术达到国际先进水平；首创了利用反应与分离耦合技术在高固含量拟低共熔体系所实现的单槽过程，大幅度提高了反应速度与产物浓度，缩短了流程，降低了成本；研发了包括气升式等系列高效生物反应器、生物分离等单元操作装置，率先形成批量生产与工程配套能力，促进了中国用生物技术生产专用化学品新领域的发展。