李校堃主要聚焦以生长因子为代表的蛋白质药物基础理论研究与新药研发，尤其是成纤维细胞生长因子（FGFs）家族蛋白的功能、系统理论与新药研究。在国际上率先开发出多种促组织损伤与再生修复的一类新药和三类载药医疗器械，广泛应用于烧伤、难愈性溃疡、重大灾害性创伤和国防战伤救治；发现并系统阐明了FGFs家族蛋白与代谢疾病相关机制，提出“生长因子代谢轴”理论假说，为相关代谢疾病的诊治提供了新思路，为生长因子治疗代谢病的新药研发奠定了重要基础。