主要从事非定常流与涡运动、运动生物流体力学、空气动力学与热力学的研究
童秉纲在非定常空气动力学领域，结合国家航天工程的需要率先开拓和发展了一套从低速直到高超声速的动导数计算方法，并发展了以有限元方法为主体的计算气动热力学建立了模拟鱼类运动的三维波动板理论，对鱼类形态适应的内在机制做出了流体力学解释在钝体尾迹的涡运动机理、可压缩性旋涡流动结构、二维涡方法等研究领域均取得重要进展。
