王正敏在改革开放前临床上偏重于危及生命疾病的诊治，成功救治众多耳鼻喉恶性肿瘤、耳源性颅内外并发症和气道异物患者；在国家困难时期与科技人员合作，研制成功国产“电测听仪”、“深低温冷刀”和“争光霉素”；采用耳鼻手术入路分别成功治疗耳源性脑脓肿和脑脊液鼻漏；与神经科合作，成功完成迷路枕下联合入路摘除听神经瘤，为中国创建颅底外科做出早期贡献；二十世纪八九十年代在中国国内率先成功开展胆脂瘤中耳炎鼓室成形术、显微激光镫骨外科、以内听道和侧颅底手术分别治疗梅尼埃病、面神经瘫痪、听神经瘤、颈静脉孔区和岩尖肿瘤；与此同时，以三明治式复合瓣修复前颅底成功发展鼻前颅底肿瘤外科；于2003年偕团队完成多导程控数字人工耳蜗原理样机，并由院方为知识产权所有者成功实现转化，惠及聋者；基础研究方面，在能转化为毛细胞的多能干细胞、chitosan包裹PsaA重组蛋白纳米疫苗、中耳胆脂瘤免疫反应及其在侵袭性致病机理中的作用以及神经性耳聋相关基因等方面均有建树。