李兰娟院士是我国人工肝事业的开拓者，创建独特有效的李氏人工肝系统，治疗重型肝炎肝衰竭，显著降低患者的病死率；1994年始建立《感染微生态学》，从微生态角度来审视感染的发生、发展和结局，率先全面揭示肝病肠道微生态宏基因组变化规律，创立微生态干预防治重症肝病新策略，为感染防治提供崭新思路；近年来承担SARS、手足口病、地震灾后防疫、甲型H1N1等传染病诊治研究任务，尤其在防控人感染H7N9禽流感救治研究中取得众多原创性成果，获国内外高度评价，为我国传染病诊治做出了重大贡献。至今获国家科技进步奖特等奖1项，国家科技进步奖（创新团队）1项，国家科技进步一等奖2项，国家科技进步二等奖2项，浙江省科技进步一等奖6项等。