主要从事器官移植领域的研究
郑树森在国际上首次提出了包含肿瘤生物学特性的肝癌肝移植受体选择标准——“杭州标准”,创建了成人活体肝移植技术体系和低剂量乙肝免疫球蛋白 (HBIG) 联合核苷类似物预防肝移植术后乙肝复发方案。